繁华大都会美国纽约，邪恶领袖施莱德率领的大脚帮在城市内为非作歹，甚嚣尘上。安保公司老板埃里克·萨克斯（威廉·菲德内尔 William Fichtner 饰）推出最新安保系统，发誓维护城市的和平。第6频道女记者爱普尔·奥尼尔（梅根·福克斯 Megan Fox 饰）偶然拍到大脚帮被四名神秘侠客挫败的画面，在第二次遭遇非常事件时，她惊讶地发现四名侠客竟然是变异后的巴西龟：拉斐尔、列奥纳多、米可朗基罗、多纳泰罗。忍者神龟的名字勾起了爱普尔儿时的记忆，当年她的父亲与萨克斯正是研究生物变异实验的伙伴。她将这个消息告诉给萨克斯，可是在和忍者神龟及其老师斯普林特会面后，才发觉萨克斯与施莱德是这座城市内的罪恶之源……...
Plankton’s world is flipped upside down when his plan for world domination is thwarted. Plankton runs the Chum Bucket restaurant alongside Karen, a waterproof computer that doubles as his sidekick and wife....
五年前，平凡的艾米特（克里斯·帕拉特 Chris Pratt 配音）拯救了乐高世界，可是德宝星球的外来者却摧毁了好不容易得到的和平。在此之后，乐高世界一片荒芜，外星来客随时在摧毁着每一座完好的建筑。这一日，来自姊姊星系的美汉将军驾驶飞船来到乐高世界，她轻易击败露西、蝙蝠侠等人的进攻，随后带着包括露西在内的五个人前往姊姊星系。在外星球，露西等人见到了随身变女王。此时，女王正筹划在新修建的太空神庙上举办盛大的婚礼，而婚礼对象就是蝙蝠侠。另一方面，艾米特独自飞往太空寻找露西，途中遭遇了豢养恐龙的神秘男子雷斯，于是他们结伴进军姊姊星系。 为了阻止末日的发生，艾米特拼尽全力……...
